主菜单界面是N3DS的核心之一。从这里我们可以运行游戏，观看视频，管理朋友列表以及更改设置。开机启动时它是最先出现的，除了进行系统设置修改时，它一直在3DS模式下后台运行。 通常主菜单进程崩溃/终止时，系统会重启主菜单。此时主菜单会显示一个手动重启系统的错误信息。
版本信息
| 系统版本 | 固件版本 | 更新日期 | 修改记录 | CDN可用性 | CDN发布日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1.0.0-0 | 0 | 2011.2.26 | 首发3DS自带固件 | 可用 | 2011.2.18 |
| 1.1.0-0 | ? | ? | 从部分游戏卡带进行升级 | 不可用 | N/A |
| 1.1.0-1 | 0 | 2011年2月某日 | 一般性bug修复
在主菜单加入了3D视频选项（仅加入了一段时间） |
可用 | 2011.3.1 |
| 2.0.0-2 | 1029 | 2011.6.6/7 | 来自官方的升级信息：（DSiWare文件管理没有说明，但是是可用的）加入了任天堂eshop ，可以使用网络浏览器。加入系统转移。可以进行对DSiWare文件的完全管理。可能进行自动的系统升级（需要连接无线网络）。 | 可用 | 2011.6.6 |
| 2.1.0-1 | ? | ? | 通过某些游戏卡带进行升级，这个固件貌似是基于2.0.0-2编辑的，目的应该是把系统版本为1.1.0-1的3DS升级，但是2.0.0-2固件更新的所有特征都没有出现。虽然这个固件的版本高于2.0.0-2, 网络浏览器似乎被删除，E-Shop没有出现，示范用视频依旧存在。但是2.0.0-2中重新设计的主菜单界面，DSiWare管理及其他特性在这个固件中均有出现。 | 不可用 | ? |
| 2.1.0-3 | 2049 | 2011.6.15 | 修正了Ridge Racer静止的bug。 | 可用 | 2011.6.15 |
| 2.1.0-4 | ? | 2011.7.25 | 提高了系统稳定性，进行了一些小的系统修改。 | 可用 | ? |
| 2.2.0-4 | ? | 2011.11.6 | 改进了Friend List. 通过诸如马里奥大陆3D的卡带升级（日版）。 | 不可用 | ? |
| 3.0.0-5 | 4111 | 2011.12.7 | 给照相机Title追加了3D视频录制功能，更新了Mii Streetpass Plaza，Download Play的3DS Title的系统间传输，改进了eShop，home menu的带链接QR扫描功能。Nintendo Zone现在可以在任何地方访问了，还为NZone追加了3D视频的流媒体支持。这一次更新,也增加了通过AGB_FIRM运行GBA VC title的支持. | 可用 | 2011.12.7 |
| 3.0.0-6 | 4111 | 2011.12.21 | Home menu 没有更新,只StreetPass的Mii广场和system title更新了。任天堂的系统升级页是这么说的：“增强了系统稳定性以及其他调整”. | 可用 | 2011.12.21 |
| 4.0.0-7 | 5131 | 2012.4.24 | Home Menu增加文件夹功能，增加游戏补丁, 购买超过1000日元的昂贵游戏(JPN) | 可用 | 2012.4.24 |
| 4.1.0-8 | 5131 | 2012.5.14 | 官方日志：“增强了系统稳定性以及其他调整”。当更新到4.1.0-8之后，系统更新再也不需要家长控制密码。 | 可用 | 2012.5.14 |
| 4.2.0-9 | 6146 | 2012.6.26 | 改进了eShop输入信用卡信息的安全性和其他不易察觉的小改进。保存的信用卡信息在这次eShop更新时候会删除，但是可以重新输入。 | 可用 | 2012.6.26 |
| 4.3.0-10 | 6146 | 2012.7.24 | eShop更新, bad word列表和NZone热点更新 | 可用 | 2012.7.24 |
| 4.4.0-10 | 6146 | 2012.9.19 | NZone热点列表更新，更新了TWL_FIRM封杀烧录卡。 | 可用 | 2012.9.19 |
| 4.4.0-10 | 6146 | 2012.10.17 | (仅中国)更新了System Settings的title。这个TWN/KOR已经有这个版本更新的title了. | 可用 | 201210.17 |
| 4.5.0-10 | 6146 | 2012.12.4 | 更新TWL_FIRM和白名单，封杀烧录卡。NZone的热点列表也更新了。 | 可用 | 2012.12.4 |
| 5.0.0-11 | 7172 | 2013.3.25 | eShop有些变化, 许多系统的 titles包括NATIVE_FIRM也被更新了。 | 可用 | 2013.3.25 |
| 5.1.0-11 | 7172 | 2013.4.4 | 更新了 NATIVE_FIRM 和 NS. 根据官方change-log: "解决了一个可能会阻止访问系统设置和其他功能的问题." | 可用 | 2013.4.4 |
| 6.0.0-11 | 8198 | 2013.6.17 | 官方更新日志：“现在，用户对任天堂下载版的3DS软件和VC游戏的存档可以进行备份”。对StreetPass Mii Plaza和照相机进行了更新。 | 可用 | 2013.6.17 |
引导启动进入Kiosk功能
系统检查游戏的banner，判断游戏能不能自动启动。如果Home Menu先被 NS加载了，它会检查Slot-1的Kiosk试玩版卡带。如果找到了卡带，它会加载卡带里的游戏，这样就不在后台运行home menu了(至少处于不运行的状态)。早于New Super Mario Bros 2(但不包括)的kiosk试玩版， 通过阻止home按钮和kiosk相结合，自动启动进入kiosk运行环境。在这个运行环境中按下电源按钮可以关机，但是home键失效了。然而，如果home menu完成初始化，并且载入了kiosk demos，运行环境就和自动启动完全一样了! 除非按下电源键看到那个灰色的关机警告界面。
New Super Mario Bros 2 demo之后又发现了新的kiosk运行环境。3DS可以像之前的DS系列一样从卡带启动。这种情况下，'Home'和'Power'键按下时会造成关机。如果长时间没有操作，kiosk试玩版会自动退出。如果home menu在kiosk试玩版装载前完全初始化了，那么'Home'和'Power'键的行为会和一般零售版游戏一样，也就是可以打开home menu。但不同点是，长期无操作的话，游戏还是会在一定时间后自动退出并进入home menu。
启动其他锁区的kiosk试玩版，demo引导启动过程中，3DS会报错“An Error has Occurred”。应用不会显示在home menu中，这一点和后面所述的一般零售游戏相同。
有引导功能的卡带可以跳过Home Menu的一些功能:
- 在活动日志中显示使用历史记录
- 绕过家长控制
- 绕过强制游戏卡更新
- 绕过3DS初始设置
- 控制台没有朋友列表
锁区
Home Menu有锁区控制的功能。所有Title的锁区区域都在ICN data中。一共有6个锁区区域：日本，美国，欧洲(包括澳大利亚)，中国，台湾，以及韩国。还有一个使Title免受锁区的值，使其能在任何版本的3DS上运行。
锁区效果
每个3DS Title——不管游戏被存储在哪里(NAND/SD卡/游戏卡带)，都会被Home Menu检查，非本区域的Title会被Home Menu拒绝显示，而用户不会收到相关提醒。然而,非本区域SD卡的Title，会在检查过程中"闪现"。对于那些不需要从Home Menu界面启动的Title(比如kiosk demos)，Home Menu会声明发生了错误并停止启动Title。
主菜单错误消息
| 对话框文本 | 描述 |
|---|---|
| "An error has occured. Please save your data ... then restart the system" （“发生一个错误，请保存数据，然后重启系统”） | 系统进程（包括主菜单）崩溃/终止时，显示此对话框。这个对话框也显示系统错误。 |