闪存文件系统
N3DS的NAND闪存芯片容量为1GB。
格式
任天堂3DS的闪存文件格式目前尚未公开，闪存芯片可以通过主板上的输出针脚进行内容提取，这已经成功了。然而提取出来的数据被加密了，不解密无法理解。
文件系统
每个NAND分区皆为FAT文件系统。
加密
NAND文件系统使用AES-CTR加密。NAND中TWL区域使用TWL的NAND密码键，而CTR区域使用CTR的NAND密码键。用于CTR-NAND扇区的密码键是由NCSD扇区的文件系统类型决定的。TWL/CTR的NAND区域在NCSD头中指定。NAND的最开始0x0B100000字节使用TWL密码键，在0x00012E00之前则只有MBR分区表使用TWL密码键(那个区域包括如下所示的TWL扇区)。
分区
| 名称 | 偏移 | 长度 | 注释 |
|---|---|---|---|
| twln | 0x00012E00 | 0x08FB5200 | TWL-NAND的FAT16文件系统(DSi) |
| twlp | 0x09011A00 | 0x020B6600 | TWL-NAND照片的FAT12文件系统(DSi) |
| 0x0B100000 | 0x00030000 | 一般在这段全部是零 | |
| firm0 | 0x0B130000 | 0x00400000 | 固件分区 |
| firm1 | 0x0B530000 | 0x00400000 | 固件分区(是备份，和上面一样) |
| 0x0B930000 | 0x2F5D0000 | CTR-NAND分区(3DS) | |
| nand | 0x0B95CA00 | 0x2F3E3600 | CTR-NAND的FAT16文件系统 |
3DS中NAND的TWL的FAT分区FAT卷标名"TWL"，而CTR的FAT分区则是"CTR"。TWL分区的偏移和长度存在MBR分区表，而CTR分区表信息存在NAND的NCSD头。CTR-NAND分区的扇面0有一个MBR分区表，而MBR的签名在+0x1fe位置。在这个分区表中只有一个分区就是CTR-NAND的FAT16分区。
以上除过TWLP，没有一个NAND物理分区可以使用ARM11直接读取。CTR/TWL的NAND文件系统只能当exheader访问控制描述符启用时候访问。对于零售版机器中的CXI进程，CTR/TWL的NAND描述符一般都是未启用的状态。ARM11只能将"nand:/rw/"挂载为"nandrw"的归档，而"nand:/ro/"则挂载为如下的nandro归档。