闪存文件系统
N3DS的NAND闪存芯片容量为1GB。
格式
任天堂3DS的闪存文件格式目前尚未公开，闪存芯片可以通过主板上的输出针脚进行内容提取，这已经成功了。然而提取出来的数据被加密了，不解密无法理解。
文件系统
每个NAND分区皆为FAT文件系统。
加密
NAND文件系统使用AES-CTR加密。NAND中TWL区域使用TWL的NAND密码键，而CTR区域使用CTR的NAND密码键。用于CTR-NAND扇区的密码键是由NCSD扇区的文件系统类型决定的。TWL/CTR的NAND区域在NCSD头中指定。NAND的最开始0x0B100000字节使用TWL密码键，在0x00012E00之前则只有MBR分区表使用TWL密码键(那个区域包括如下所示的TWL扇区)。
分区
| 名称 | 注释 |
|---|---|
| firm0 | 固件分区 |
| firm1 | 固件分区 |
| nand | CTR-NAND文件系统。（N3DS） |
| twln | TWL-NAND文件系统，（NDSi） |